色譜柱是高效液相色譜儀重要的核心部件。色譜柱由柱管、壓帽、卡套（密封環）、篩板（濾片）、接頭、螺絲等組成。柱管多用不銹鋼制成，壓力不高于70Kg/cm2時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同還有使用熔融硅或玻璃襯里的，用于細管柱。色譜柱兩端的柱接頭內裝有篩板，是燒結不銹鋼或鈦合金，孔徑0.2-20um(5-10um),取決于填料粒度,目的是防止填料漏出，柱內徑一般是根據柱長、填料粒徑和折合流速來確定，目的是為了避免管壁效應。

液相色譜柱的選擇一般基于分離規模、分析物的性質、色譜柱規格和填料的性質幾個原則。

1、根據分離規模確定選擇分析型色譜柱還是制備型色譜柱。
2、根據分析物的pKa、log P值、分子量、化學結構等確定其溶解性，確定合適的分離模式和色譜柱。
3、色譜柱確定后，根據色譜柱柱長和內徑對于分離的影響選擇合適的柱長和內徑。
4、根據填料的基質——粒徑、孔徑、比表面積，硅膠純度、顆粒形狀、機械強度，鍵合相、鍵合密度、封端等情況確定合適的色譜柱，即完成高效液相色譜柱的選擇。

現在商品化的液相色譜柱琳瑯滿目，根據以上原則可以給我們提供一個初步的選擇，但由于各個儀器廠商的填料技術和鍵合技術都有差異，即使都是C18柱，同一品牌不同系列都有不同的功能。所以在選擇色譜柱時要結合自己的需求才能找到合適的色譜柱。